Sytuacja w kraju jest bardzo niestabilna. Brakuje podstawowych usług, a katastrofy naturalne, takie jak silne powodzie, co roku dotykają jego mieszkańców. Szacuje się, że pomocy potrzebuje prawie ⅔ mieszkańców Sudanu Południowego. Wiele osób migruje w inne części kraju lub poza jego granice w poszukiwaniu bezpiecznego schronienia, żywności i wody.
Konflikty, wysiedlenia oraz powodzie i epidemie, których doświadcza Sudan Południowy, utrudniają produkcję żywności. W kraju otrzymuje się krytyczny poziom niedożywienia oraz poważny brak bezpieczeństwa żywnościowego.
Powodzie zniszczyły infrastrukturę wodno-sanitarną – dostęp do czystej wody i toalet jest bardzo utrudniony. Takie warunki zwiększają ryzyko wybuchu epidemii chorób przenoszonych drogą wodną.
